網絡圖為篩選出的核心基因之間的關系,通過圖論的方法計算出關鍵基因,并通過關鍵基因的共表達基因預測出其功能。
時間序列的共表達網絡介紹
根據基(ji)因表(biao)達(da)信(xin)號值(zhi)隨著(zhu)時間(jian)序(xu)列的(de)變化,計算(suan)基(ji)因間(jian)的(de)共表(biao)達(da)關系(xi),得到(dao)基(ji)因間(jian)的(de)表(biao)達(da)調控(kong)(kong)關系(xi)及(ji)調控(kong)(kong)方向,從而構建基(ji)因的(de)表(biao)達(da)調控(kong)(kong)網絡。利用(yong)此網絡圖,研究(jiu)者可通過(guo)分(fen)析基(ji)因調控(kong)(kong)能力(li),獲得樣本在時間(jian)過(guo)程中起調控(kong)(kong)作用(yong)的(de)基(ji)因。
時間,濃度,邏輯變化的樣本的差異基因,趨勢分析篩選的基因或關注的基因。
1、圖片文件(Network 圖),包括 png,PDF 格式;
2、Cytocape 文件:可以 cytoscape 打開進行細節調整;
3、文本文件:基因之間共表達相關性以及顯著性,基因核心共表達的排序。
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